青海师范大学体育学院科研工作主要通过学院青海师范大学青藏高原体育训练研究所进行科研活动的管理、组织、协调和服务工作。研究所所长由主管科研的院长兼任，包括两个行政职能科室：研究所办公室（所长一名，科研秘书一名）；研究所资料室（科研秘书管理）；下设五个研究团队：“青海少数民族传统体育文化研究团队”、“青藏高原体育健身与训练研究团队”、“高原大学生体质与健康研究团队”、“篮球教学理论与实践研究团队”以及“全民健身理论与方法研究团队”。

近年来通过与对口支援学校北京体育大学合作，与外聘讲座教授合作，在我校高原科学与可持续发展研究院支持下又成立了“高原运动与健康研究团队”、“高原环境生物学机制研究团队”、“高原运动与脑科学研究团队”三个研究团队。